看到这些生化机器人以战友们的面目在身旁走来走去，西蒙斯紧紧拉着菲兹的手，十分紧张。她担心着这些生化人会将他和菲兹杀死或者隔离，菲兹安慰她使她镇静下来，他们必须装作若无其事，因为他们现在唯一的优势是发现了真相，这些生化人还没意识到被他们发现了。

这时，生化人菲尔、迈克、黛西、杰弗瑞走了进来，菲尔要菲兹召集全球异人，菲兹假意同意了，杰弗瑞想拆开西蒙斯和菲兹，菲兹找借口拒绝了他。杰弗瑞和菲尔商量着要赶紧下手，干掉并用生化人替换掉西蒙斯和菲兹，菲尔说先谨慎行事。

悠悠球是神盾局最有价值的异人之一。生化异人迈克先跟她取得联系，引她上钩。生化菲尔去找到生化梅，当梅发现了菲尔不是原来那个，表现得很抗拒。她跟生化菲尔的设计程序不同，她原来一直以为自己就是梅，很久后才发现自己不是，这种自我否定让她难受。生化菲尔是一开始就明白他是什么。他欣赏并向往博士创造的框架，认为那是个新世界，没有伤痛和遗憾的新世界。他说服梅接受这个框架，在这个框架里，他可以和生化梅在一起。

西蒙斯和菲兹一起来到工作室，可是西蒙斯突然发现仪器检测他俩之中有生化人，西蒙斯大惊失色，迅速掏出枪指住了菲兹，她让菲兹豁腕证明，菲兹割腕后流出了大量鲜血，看到血西蒙斯觉得菲兹不是生化人，急忙奔过去帮他，结果菲兹反手将刀刺进了她的小腿。原来这个菲兹也是生化人。

博士醒来后，艾达告诉他，四个生化人已在神盾局就位，很快她也要用生化人替换掉西蒙斯和黛西了。

生化菲兹正在扫描西蒙斯的大脑额叶时，西蒙斯清醒过来，她挣扎着去拿了大锤，砸伤了菲兹，并用匕首扎死了生化菲兹。

黛西进入楼下的隔离室时，发现了满屋里都是跟自己一模一样的黛西模型，她马上明白发生了什么。等生化迈克起来时，黛西急忙装成模型，一动不动地站在里面。迈克提着枪一一察看，趁其不备，黛西袭击了他并跑出了模型屋。

黛西躲到暗处，打开平板查看，发现了菲尔、杰弗瑞和迈克都是生化人，生化人菲兹躺在地上。这时，黛西发现西蒙斯也躲在这个房间，她们彼此成为了依靠，紧紧拥抱在一起。

艾达观察人类越多，越感觉自己的思维出现了悖论。她被博士设定的两个主参数发生了矛盾。一个主参数是保护框架，另一个是保护博士，但她现在认为，博士是框架最大的威胁。因为他让她为每个进入框架的人弥补一个遗憾，这说明博士自控力很差，她认为博士如果有一天后悔创造了框架，就会修改参数拆毁框架。博士说这不可能，因为他坚信框架是真实的，可以替代原来充满遗憾的所谓真实人生。

艾达听了他的话露出了笑容，说这个解释解决了悖论。她割破了博士的手腕，将他也置于框架之中，博士挣扎了两下就昏迷了过去，和梅、菲尔等原来被他们控制的那些人一模一样。

菲尔和杰弗瑞将神盾局特工们全部召集起来，向他们宣布，西蒙斯和黛西被绑架并替换成了生化人。他们下令要杀死俩人。

这点黛西和西蒙斯想到了，她们商量着下一步该怎么做。听西蒙斯说框架的源信号无法查找，黛西说那我们必须黑进去，接入框架，然后找到我们自己人唤醒他们。

黛西用催眠气体弄晕了所有特工，只剩下杰弗瑞等四个生化人了。黛西好容易才战胜了生化杰弗瑞，却被随后赶来的迈克和菲尔射中。趁他们以为胜券在握时，黛西积聚起所有力量，一击而中，俩人同时被震碎，他们的身体碎片落地后，清醒了的其它特工们才明白了西蒙斯和黛西才是没被替换掉的人。

黛西和西蒙斯安排大家抢救同事，并准备启动和风。她们推着硬件准备离开，一开门却发现生化梅正堵在前面，手握着巨型炸弹的开关。黛西和西蒙斯说服了这个比其它生化人更像梅的生化梅，她放走了她俩。

已修好的生化菲兹又将生化菲尔修复好，生化菲尔准备启动隔离室里的黛西战队。他赶到生化梅呆的地方，发现她放走了黛西和西蒙斯。梅告诉菲尔，她被设计的程序是拿回《黑暗战书》，欲望是接近菲尔保护菲尔，而面前的这个菲尔不是真的。听闻此言，菲尔迅疾地掏枪指向梅，梅按下了炸弹的开关，熊熊的火焰吞没了他们。

火焰席卷而来之前，西蒙斯黛西和特工们乘坐的和风一号起飞离开了。劫后余生的她们将手紧紧握在一起。

她们把下一步的计划告诉了特工们，悠悠球不安地听着，不停地走来走去。特工们意识到，如果俩人在框架里待得太久，她们的身体会衰竭。事实上情况更严重，如果俩人在框架中死了，那么在现实中也就真的死了。但顾不上那么多了，黛西告诉大家要立即行动。

俩人被接入了框架之中。生化黛西醒来，发现收到了一条短信，让她叫醒林肯，因为神盾局在召集他们。这一直是真正的黛西内心最大的遗憾，现在在框架世界里，这遗憾正在被弥补。

生化黛西走进卧室，床上躺着的是她的林肯。从未失去的安然无恙的林肯。她的眼中马上露出了充盈着幸福感的目光。在框架之中，菲尔迈克都是普通平凡的人，过着安宁幸福没有遗憾的平常时光。